细菌。
和美国国立卫生研究院（USNationalInstituteofHealth，NIH）
马里奥·勒德雷尔合作（MarioRoederer），以1000对双胞胎为研究对象，
们检测
位于肠道和血液中、与微生物进行信息传导免疫细胞——调节性T细胞（T-regulatorycells）。结果发现它们主要由基因决定，在不同人身上变异较大。[86]可以这样说，基因部分决定哪些微生物会在肠道蓬勃生长，免疫系统又会如何反应。
所以，基因表达并不是像以往认为那样，
成不变，而是像调光钮样，可以增强或削弱。通过这“后生过程”（epigeneticprocess），人类得以适应新环境和饮食。也是通过这过程，人类与体内微生物实现信息传导，而微生物通过激活或者沉默基因表达影响们生理功能。随着时间流逝，饮食（或说饮食中微生物）慢慢改变基因表达，使肠道环境（生长土壤）变得更适宜，越来越多样微生物于是得以定居并繁殖。
跟着肠道“直觉”走
肠道中微生物对婴儿脑和神经系统发育很关键。可靠证据表明微生物特别是酸奶中乳酸菌和双歧杆菌会通过脑—肠轴（brain-gutaxis）影响脑重要区域。肠道拥有除人脑外第二大神经网络系统，因此被称为“第二个脑”。据估计肠道中神经元长度和神经元连接数目与猫脑神经网络规模相当——猫可是以机敏、自和拥有九条命这些特点获得人类垂青。也许们应该多关注们肠道。
大脑和肠道通过复杂信号系统实现信息传递，调控许多生理功能，特别是进食和消化，但现在人们发现其功能还不止于此：比如它还会影响情绪。患有肠胃不适病人和负责治疗医生早就观察到肠胃不适会导致恶心、食欲不振、活动减少和情绪低落，可能发展成短期抑郁。
近期们研究对罕见双胞胎，其中之患有抑郁症，另个则情绪乐观。们发现抑郁双胞胎之，血中重要化学物质——血清素（serotonin）水平有所降低。这种物质主要来源于食物，在断食情况下则由肠道微生物生成。因此肠道微生物改变会引起其浓度变化，进而影响情绪。这也可以解释为什
有人在断食后会出现莫名欣快愉悦之感。
目前已知至少有16种特殊称为肠激素化学信号分子，由肠道释放入血，并将信号传递到脑
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