电脑辅助设计及作图
看来,“GIFT”这个软件的作用,是根据基因信息,预测能制造出怎样的蛋白质,描绘其实际形态,并设计与蛋白质结合的物质的化学结构。
“就是说,按照这个软件的指示制药就行了?”
“总觉得有点假。”土井说,“我对电脑辅助制药可不在行,你最好去问别人。”
“你有懂这方面的朋友吗?”
看了好一会儿,研人才意识到,这可能是细胞膜表面的放大图像。一微米不到的极小世界被展示在了十五英寸的屏幕上。
“看上去有点怪啊。”土井移动着鼠标,指着左侧的两个窗格说,“这里是相关信息。这幅CG图是‘变种GPR769’。”
原来如此,研人终于开窍,这就是问题受体。父亲想要得到的,就是能结合进中心凹陷处的物质。
“下面的窗格,写着制造这个受体的基因的碱基序列。可是……”土井双臂抱胸,“你知道GPCR有多少种吗?”
“七八百种?”
制造拥有该受体的个体,然后喂食化合物,评估实际的效果。”
研人想起了那座破楼里饲养的四十只小白鼠。
“这么说,这个方法没有错?”
“也不是……”土井摇头道,“怎么看都太简单了。而且,临床试验及其后的步骤全都省略掉了。说句不好听的话,太不专业了。”
“是啊。”研人附和道。父亲是病毒方面的学者,说他在制药方面不专业也不为过。“那这个呢?”
“这方面……”土井
“是的,其中只有一种的形态被真正掌握,那就是牛的网膜细胞上的受体。对于其他GPCR,只能类推其结构。也就是根据基因的碱基序列的相似度,推测其完成品。这个模型多半也是这样生成的,但我不能完全确定。”
“这个软件还有什么别的用途吗?”
“这个嘛……”土井顿了顿,拿起实验记录的复印件,“也许这个软件是用在最初的两个项目上的。”
研人把头探过来查看。
变种GPR769的立体结构分析
研人从背包里取出A4大小的白色笔记本电脑,启动后说:“你懂Linux吗?”
“一点点。”土井答道,操作了一会儿电脑说,“里面装的软件我没见过。你听说过‘GIFT’吗?”
“没。”
土井启动了“GIFT”软件。数秒后浮现出的画面,令两人同时惊呼起来。
窗格分为三列,占据右半部分的大窗格中,显出一幅奇特的CG图像。微微起伏的平面上,布满厚花瓣一样的突起,中心是袋状空洞。图像精致而怪异,让人怀疑是相机拍出来的。