本无法与泡利相提并论：“泡利提出
不相容原理，分析电子自旋，奥本海默则没有为物理学做出过这种根本性
贡献……”但是，爱因斯坦和外尔也不得不承认，奥本海默“建立美国最大理论物理学院系”。不过，当他们注意到他学生
致称赞他是位好老师后，两人又警告说：“这可能是因为他太强势，以至于他学生都成缩小版奥本海默。”根据这建议，高等研究院在1945年向泡利抛出橄榄枝，但泡利拒绝。
尽管有些不情愿，爱因斯坦最终还是对这位新院长产生敬意，他形容这位院长是位“能力超群、博学多识之人”，但他钦佩只是奥本海默为人，而不是他专业。尽管如此，爱因斯坦也从来没把奥本海默当成自己密友，“也许部分原因是
们科学见解截然不同”。早在20世纪30年代，奥本海默就曾因爱因斯坦顽固地拒绝接受量子理论而称他为“十足疯子”。奥本海默请到普林斯顿所有年轻物理学家都笃信玻尔量子理论，他们对爱因斯坦那些挑战量子世界观问题毫无兴趣，他们无法理解为什
这位伟人不知疲倦地想要建立种“统场论”来取代他所谓量子理论矛盾之处。这是项孤独工作，然而他颇为满足于继续为“上帝不掷骰子”辩护，这句话也是他对量子力学基础之——海森伯不确定性原理扼要批评。爱因斯坦并不介意普林斯顿大多数同事“把看作异端和保守派，认为已经过气”。
对于这位广义相对论提出者，奥本海默深深钦佩他“非凡原创思维”，“这是几何和万有引力奇妙结合”，但是他认为爱因斯坦“将根深蒂固传统观念带到他原创性工作中”。奥本海默坚信，在爱因斯坦后来职业生涯中，正是这种“传统观念”误导他。让奥本海默感到“悲哀”是，在普林斯顿高等研究院这些年，爱因斯坦直想证明量子理论存在严重不自洽，所以是有缺陷理论。奥本海默写道：“他总能想到出人意料又机智反例，在这方面没人比他更别出心裁，但事实证明并不存在所谓自相矛盾。在爱因斯坦自己早期理论中就能找到化解这些矛盾办法。”量子理论让爱因斯坦感到不满地方是关于不确定性概念，然而正是他自己对相对论研究激发玻尔灵感。奥本海默认为这极具讽刺意味：“他以种高雅而激烈方式与玻尔对战，他反对正是因他而生又被他憎恶理论。这种事在科学界已经不是第次。”
不过这些
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