是以恐怖小说而登上作家舞台
，但从本质上说，他还是应该被算作
位相当优秀科幻作家。日本《SF杂志》就将小林泰三列为日本“硬科幻新御三家”之（另两位是林让治和野尻抱介，三个人名字首字母恰好拼成NHK——日本广播协会）。与《玩具修理者》同收于本书另篇《醉步男》就显示
小林泰三在纯科幻领域功力。这篇小说巧妙地借用来自《万叶集》日本古代传说，描写犹如醉酒之后不知身在何方、彷徨于无限时空中男子，在极力烘托诡异气氛同时，充分展现作者对于量子理论范畴下时间、意识以及因果关系等概念深刻理解。有意思是，这部小说在许多方面都和当年热门电影《蝴蝶效应》异曲同工，但是和导演剪辑版电影结局中主人公可以选择自己死亡相比，小林泰三笔下人物无疑显得更加不幸：无论血沼或者小竹田，连选择自己死亡权利都没有……这篇小说于问世第二年便获得第28届日本星云奖短篇小说奖提名，显示出评论界对于小林泰三科幻创作肯定。
来自读者反馈同样是肯定。2001年，小林泰三出版他科幻长篇《ΑΩ》。这篇小说描写种奇异、与人类生命形式截然不同等离子生命体。在故事中，这种生命体中员“伽”，为追寻敌对“影子”而来到地球，但“伽”出现无意中影响到架客机正常飞行，造成飞机坠毁，机上乘客也随之死亡。“伽”就在这种情况下寄生到机上乘客之作家诸星隼人身上，奇异冒险经历也就随之展开……这篇小说获得第22届日本科幻大奖提名，同时被《SF杂志》读者选为2001年度最佳科幻小说第名，显示出读者们对于“”中科学幻想故事认同。
2002年，小林泰三另部短篇小说集《看海人》问世。这部小说集收录他自1998年以来发表于《SF杂志》上多篇文章，可以说篇篇都是佳作，尤其是同名作品《看海人》。这篇小说描写个居住在山上少年与生活在海边少女之间爱情，但在他们面前却有着无情物理规律阻隔：因为在这个世界上，距离海面越近，时间流逝就越慢；距离海面越远，时间流逝也就越快。于是对于山上少年来说，少女永远都是年轻可爱；但是对于海边少女来说，相爱人却几乎是在瞬间便年华老去……这样设定不禁让人想起麻省理工学院物理教授阿兰·莱特曼笔下《爱因斯坦梦》，不过相比
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